北交所完整交易规则与各项收费标准清晰划分，涵盖交易时间、委托方式、涨跌幅限制以及佣金、印花税、过户费全部类目，参与北交所交易的投资者可以对照规则规划交易成本与操作节奏。北交所整体交易制度衔接A股场内交易体系，同时设置专属准入门槛与价格波动限制，普通投资者开通账户需要满足资金与交易经验双重条件，股票买卖采用竞价交易模式，盘中连续竞价阶段遵循价格优先、时间优先的基本原则，集合竞价分为开盘集合竞价与收盘集合竞价两个时段，开盘集合竞价确定当日开盘价格，收盘集合竞价统一确定收盘价，避免尾盘价格大幅异动，委托申报分为限价申报与市价申报两类，市价申报仅在连续竞价期间可以使用，限价申报则全程均可提交，申报数量以100股为一手，单笔申报数量不低于100股，超过部分以1股为单位递增，卖出时不足100股的零散股份需要一次性全部申报卖出，不允许拆分零散股份分次委托。
涨跌幅波动规则是北交所交易规则的核心内容，新股上市前五个交易日不设置价格涨跌幅限制，盘中设置临时停牌机制，当盘中价格较开盘价首次上涨或者下跌达到30%、60%两个档位时，会分别触发临时停牌，单次停牌时长为10分钟，停牌期间依然可以接受委托申报，停牌结束后恢复连续竞价交易，上市五个交易日之后的正常交易阶段，股票日涨跌幅限制调整为30%，相比主板涨跌幅幅度更高，股价波动空间更大，短线交易机会更多，同时持仓风险也随之提升，连续竞价阶段还设有有效申报价格范围，防止投资者提交偏离现价过多的委托单，避免出现极端报价扰乱盘面走势，大宗交易独立于竞价交易之外，针对大额股份转让设置专门渠道，大宗交易成交价格不在实时行情当中直接体现，成交信息盘后统一披露，大额资金进出不会对盘中股价造成即时冲击。
交易费用由券商佣金、印花税、证券过户费三个部分组成，各项费用收取标准有着统一规定，印花税仅针对卖出股票单边收取，买入环节无需缴纳，这一规则和沪深主板保持一致，税率固定不变，税费直接由交易所代扣代缴，过户费由中国证券登记结算机构收取，买卖双向收取，按照成交金额的固定比例计费，覆盖股份登记过户产生的服务成本，券商佣金属于双向收费，买入和卖出股票都会收取，佣金比例没有统一固定数值，由投资者与开户券商协商确定，不同资金体量、交易频率的用户佣金费率存在差异，高频短线交易者可以争取更低的佣金标准，佣金设有最低收费额度，单笔委托成交金额较低时，按照最低佣金标准收取，不会因为成交金额过少产生极低的佣金费用。
两者交易逻辑差异明显，虚拟货币交易无涨跌幅约束、成交不受时间限制，而北交所有着严格的交易时段划分，仅工作日进行交易，节假日休市无法操作，上午集合竞价与连续竞价、下午交易时段划分明确，非交易时间提交的委托单会进入券商委托队列，等到下一交易日集合竞价阶段统一报送交易所，资金存取也仅在交易日内办理，T+1交收制度决定当日买入的股票无法当日卖出，必须等到下一交易日才能进行卖出操作，资金回笼存在时间间隔，无法实现虚拟货币那样即时买卖、资金即时划转的模式，整体资金周转节奏更平缓，需要投资者调整频繁交易的操作习惯，结合股价波动规则合理规划持仓周期，区分短线波段与中长期持仓不同策略。
